样品的采集和制备是确保检测活动有效性的关键因素之一，农产品质量安全追溯系统的采样的过程应确保抽样工作的公正性和样品的代表性、真实性。应按样本数量大小，确定抽样样品数。抽取的样品，应能充分地代表该批次产品的特征。
1农产品质量安全追溯系统的抽样原则
1.1随机性
抽出的用以评定整批产品的样品，应是不加任何选择的，按随机原则抽取。
1.2代表性
抽样所得的样品应具有足够的代表性，应是以从整批产品中所取出的全部个别样品(份样)集成大样来代表整批产品，不应以个别样品(份样)或单株或单个果实来代表整批。抽取混合样品，不能以单株或单个果实作为抽取样品。生产地抽样时应避开病虫害等非正常植株。
1.3可行性
抽样的方法、使用的工具及样品数量应是合理可行、切合实际的，符合样品检验的要求，应在确保随机性、代表性的基础上做到快速、经济、可操作性强。
1.4公正性
抽样工作应在承担任务的机构主持下完成，抽样人员应亲自到现场抽样。受检单位人员可陪同抽样，但不应干扰已定抽样方案的实施。

2抽样准备
2.1抽样方案的编制
根据抽检任务的要求，制定抽样方案，方案应包括：抽样地点（区域、城市、抽样点）、抽样人员、抽样时间、所抽样品名称和数量、抽样程序、所抽样品的包装、处理和运输。
2.2抽样用品的准备
文件类：抽检任务相关文件、抽样工作单、记录本、抽样人员的工作证件等。
工具类：抽样袋、保鲜袋、纸箱或冷藏箱、标签、封条等，异地抽样还要准备样品缩分用无色聚乙烯砧板或木砧板，不锈钢食品加工机或聚乙烯塑料食品加工机、高速组织分散机、不锈钢刀、不锈钢剪、旋盖聚乙烯塑料瓶、具塞玻璃瓶等。保证用具洁净、干燥、无异味，不会对样品造成污染。
3抽样地点
3.1生产基地
当蔬菜种植面积小于10ha时，每1ha～3ha设为一个抽样单元；当蔬菜种植面积大于10ha，每3ha～5ha设为一个抽样单元。
在蔬菜大棚中抽样，每个大棚为一个抽样单元。
每个抽样单元内根据实际情况按对角线法、梅花点法、棋盘式法、蛇形法等方法采取样品。
每个抽样单元内抽样点不应少于5点。
个体较大的样品（如大白菜、结球甘蓝），每点采样量不应超过2个个体，个体较小的样品（如樱桃番茄），每点采样量0.5 kg～0.7 kg。若采样总量达不到规定的要求，可适当增加采样个体。
每个抽样点面积为1m2左右，随机抽取该范围内同一生产方式、同一成熟度的蔬菜作为检测用样品。
注：一个基地如大棚数量多，则抽取部分大棚作为抽样单元。
3.2农产品质量安全追溯系统的生产企业
从样品库中随机抽取。
3.3批发市场
散装样品：应视堆高不同从上、中、下分层取样。
包装产品：堆垛取样时，在堆垛两侧的不同部位上、中、下过四角抽取相应数量的样品。
3.4农贸市场和超市
同一摊位抽取的同一产地、同一种类蔬菜样品为一个批次。为避免二次污染，尽可能从原包装中取样。
3.5注意事项
选择抽样地点时，首先应确定一个预定的抽样点，同时还应确定一个备用抽样点。在预定的抽样点抽不到需要的样品时，可以用与预定抽样点大小相当、距离接近的备用抽样点代替。抽样点变更，应在抽样工作单的备注中注明。
抽样点的分布应在所抽区域的不同方位，相同名称的超市原则上只抽一个。
4抽样人员
抽样人员应经过培训，取得相应的资质。每一抽样点抽样人员不应少于2人。其中一人应具有抽样工作经验，负责对抽样工作程序的具体实施及相关情况的协调处理。抽样人员应态度端正，工作作风严谨。
5抽样时间
5.1生产基地
根据不同蔬菜品种在其种植区域的成熟期来确定，抽样应安排在蔬菜成熟期或蔬菜即将上市前进行，在喷施农药安全间隔期内的样品不要抽取。抽样时间应选在上午的9时～11时或者下午15时～17时。下雨天不宜抽样。
5.2批发市场
宜在批发或交易高峰时期抽样。
5.3农贸市场和超市
宜在抽取批发市场样品之前进行。
5.4生产企业
库房中有样品时抽样。
5.5农产品质量安全追溯系统的注意事项
任何抽样点在一个月内，某一种样品的抽样次数不能超过这种样品计划抽样次数。假如一种样品在一个月内、某一抽样点抽取两三次，那么每次抽样时间要间隔几天。
抽样时间应注意避开法定节假日。
6抽样量
按GB/T 8855规定执行。规定抽3 kg 的样品允许抽样量范围为2.5 kg~3.5 kg，但抽样量不应小于允许抽样量范围的下限。(http://www.sul2100.cn/yiqizhantings7.html)